故事之中，天地混沌，明暗未分，人妖鬼怪共存。年轻的阴阳师晴明（赵又廷饰）承师命前往天都城参加祭天大典，封印被镇压三百余年的祸蛇，阻止其为祸人间。然而祸蛇恃欲而强，晴明与武士博雅（邓伦饰）、南疆法师（春夏饰）以及司天监内廷法师鹤守月（汪铎饰）合力联手斩蛇除妖。